Для начала вам понадобится программа VirtualDubMod, потом вам нужно скачать фильтр для "вшития" субтитров и закинуть его в папку "plugins"
После этого заходим в VirtualDubMod и открываем нужный нам фильм File > Open Video File
Далее нам нужно добавить сам фильтр в VirtualDubMod Video > Filters > Add > TextSub
После этого вам предложит программа выбрать (открыть) субтитры
Теперь в меню Video>Compression (что бы у вас был активен этот пункт, у вас должно стоять чуть ниже "Full Processing Mode") выбираете нужный вам, кодек формат и т.п. для расчеа размера можете так же использовать имеющийся внизу калькулятор, который высчитает нужный вам битрейт фильма с учетом продолжительности и т.п.
После того, как вы сделали все нужные настройки сохраняем фильм File>Save as уже с субтирами и через некоторое время все будет готово. Удачи!!!